Kao pionir razvoja hidroenergetike u Hrvatskoj, Elektroprojekt je sudjelovao u razvoju gotovo cijelog hrvatskog hidroenergetskog sustava u kojem je projektirao većinu hidroelektrana.
Projektiranje hidroenergetskih objekata je jedna od najzastupljenijih djelatnosti Elektroprojekta. Takve je projekte razvijao i razvija i u regiji i u inozemstvu.